Innovatie om tientallen ziekteverwekkers in planten tegelijk te detecteren

Voorheen was het nodig om voor iedere specifieke bacterie, virus, schimmel of nematode een specifieke diagnostische test te gebruiken, maar met het Luminex-systeem kan dit tegelijk.

Trefwoorden: #bacteriën, #diagnose, #planten, #test, #Wageningen UR, #ziekteverwekkers

Lees verder

Nieuws

( Foto: Wageningen UR )

ENGINEERINGNET.NL - Het hart van de Luminex-techniek wordt gevormd door kleine ‘pareltjes’ van ongeveer zes micrometer groot.

In totaal zijn er nu ruim honderd verschillende soorten minuscule bolletjes beschikbaar, die allemaal hun eigen ziekteverwekker in het plantmateriaal kunnen traceren. ‘Op die pareltjes kunnen we specifieke antilichamen plakken, die heel gericht met een eiwit van een bepaalde ziekteverwekker reageren’, zegt één van de ontwikkelaars van de test, Wageningen UR-onderzoeker Jan Bergervoet.

‘Als we van een potentiële ziekteverwekker nog géén antilichamen hebben, dan kun je ook stukjes specifiek DNA of RNA van het betreffende pathogeen nemen. Meng je een hele serie van die verschillende pareltjes met wat vermalen plantmateriaal, dan kun je de bolletjes die hun ziekteverwekker hebben gevonden vervolgens laten “oplichten” met een fluorescerende kleurstof. Die worden dan weer door het Luminex-apparaat gedetecteerd, waarna je weet wat er in je planten zit. En ook wat niet, natuurlijk.’

Met de nu ruim honderd beschikbare pareltjes kunnen tientallen notoire plaaggeesten tegelijkertijd worden gedetecteerd, vertelt Bergervoet. ‘Tegen meerdere ziekteverwekkers in tomaat, bijvoorbeeld het tomatenmozaïekvirus en het tomatenbronsvlekkenvirus, hebben we antilichamen beschikbaar. En voor de pospiviroiden (onder andere de Potato Spindle Tuber Viroid) hebben we specifieke merkers die we op de pareltjes kunnen hechten.’

‘De 'Multiplex Luminex-techniek' is niet alleen handig voor grotere telers’, zegt teamleider Diagnostiekontwikkeling, Peter Bonants. ‘Voor die telers is het natuurlijk goedkoper en sneller om in één keer een hele serie mogelijke ziekteverwekkers te checken. Maar ook voor bijvoorbeeld plantenziektekundige diensten is het goed om materiaal voor in- of export in één keer te kunnen testen.’

Er zijn nu al verschillende ‘kits’ beschikbaar en gevalideerd voor verschillende antilichamen en DNA- of RNA-markers. ‘Maar dit systeem blijft per definitie continu in ontwikkeling’, zegt Bonants.

‘We zullen steeds nieuwe antilichamen en DNA- of RNA-markers proberen te vinden voor weer nieuwe ziekteverwekkers, en ook voor zogenoemde look-alikes, die met conventionele diagnostiek nog wel eens vals positieve uitslagen genereren.

De bacterie Clavibacter bijvoorbeeld, kent in de tomatenteelt bacteriën die kruisreageren met de conventionele diagnostiek. Met dit systeem kun je in één run ook die look-alikes aantonen of uitsluiten.